H NetU ανέλαβε την υλοποίηση της δεύτερης γενιάς του Εθνικού Πληροφοριακού Συστήματος Schengen ΙΙ για την Ελλάδα. Η σχετική σύμβαση μεταξύ του Αρχηγείου Ελληνικής Αστυνομίας και της NetU υπογράφηκε τον Ιούνιο του 2012 και το σύστημα έχει τεθεί σε επιχειρησιακή λειτουργία τον Απρίλιο του 2013, σύμφωνα με το χρονοδιάγραμμα της Ευρωπαϊκής Επιτροπής. Η λειτουργία του συστήματος αποτελούσε υποχρέωση της Ελληνικής Δημοκρατίας σαν μέλος της Συνθήκης του Schengen.
Το σύστημα Schengen ΙΙ αποτελεί ένα διακυβερνητικό πληροφοριακό σύστημα το οποίο υποστηρίζει την αποδοτική εκτέλεση των προνοιών της Συνθήκης του Schengen και θεωρείται σαν το μεγαλύτερο πληροφοριακό σύστημα για τη δημόσια ασφάλεια στην Ευρώπη. Σκοπός του είναι η επίτευξη ενός υψηλού επιπέδου ασφαλείας μέσα στην περιοχή ευθύνης της Ευρωπαϊκής Ένωσης, διευκολύνοντας παράλληλα την ελεύθερη διακίνηση εντός του χώρου Schengen. Το σύστημα χρησιμοποιείται από τα κράτη μέλη που συμμετέχουν στη Συνθήκη του Schengen με στόχο την καταχώρηση, συντήρηση, διανομή, ενημέρωση, επεξεργασία και αναζήτηση πληροφοριών (περιλαμβανομένων βιομετρικών) σχετικών με τη συνοριακή ασφάλεια και την τήρηση του νόμου.
Το σύστημα διαχειρίζεται πληροφορίες για πρόσωπα τα οποία ενδεχομένως να είχαν ανάμιξη σε σοβαρά εγκλήματα ή ενδεχομένως να μην έχουν το δικαίωμα εισόδου ή παραμονής στην Ευρωπαϊκή Ένωση. Περιλαμβάνει επίσης ειδοποιήσεις για αγνοούμενα πρόσωπα, όπως για παράδειγμα παιδιά, καθώς και πληροφορίες για συγκεκριμένα περιουσιακά στοιχεία όπως τραπεζογραμμάτια, οχήματα, πλωτά σκάφη, αεροσκάφη, εμπορευματοκιβώτια, οπλισμό και ταξιδιωτικά έγγραφα τα οποία μπορεί να έχουν κλαπεί, υπεξαιρεθεί ή απολεσθεί. Τα Εθνικά Συστήματα Schengen II των κρατών μελών είναι διασυνδεδεμένα μεταξύ τους μέσω του Κεντρικού Συστήματος Schengen II το οποίο βρίσκεται στο Στρασβούργο. Στην Ελλάδα, το σύστημα χρησιμοποιείται από περισσότερους από 65.000 χρήστες. Σε ευρωπαϊκό επίπεδο, οι χρήστες του συστήματος υπερβαίνουν τα 3 εκατομμύρια.